home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ PD ROM 1 / PD ROM Volume I - Macintosh Software from BMUG (1988).iso / Education / Chemistry / ChemIntosh Demo / ChemIntosh Description next >
Encoding:
Text File  |  1987-05-11  |  9.8 KB  |  209 lines  |  [TEXT/ttxt]
  1. What ChemIntosh Desk Accessory Can Do
  2.  
  3. Introduction
  4.  
  5. ChemIntosh Desk Accessory is a powerful drawing tool for chemists.
  6. It simplifies the creation of chemical structure diagrams.  It can be
  7. used with word processors and other applications for drawing.  With
  8. a word processor, draw the diagram in ChemIntosh DA and then copy
  9. it into your document.  You can combine the graphics produced by this
  10. desk accessory with other object-oriented drawing programs, such as
  11. MacDraw or SuperPaint.  These applications can be used to include
  12. your structural diagrams in complex figures for later inclusion in a
  13. word processing document.
  14.  
  15. ChemIntosh DA operates much like other Macintosh drawing
  16. applications.  You will often be able to guess how the palette tools
  17. work if you are familar with MacDraw.  The brief description below
  18. will provide you with more details.  The question mark icon in the
  19. palette will give you on-screen help.  Click the icon and then one or
  20. more other palette icons to display the help messages.  When you’re
  21. finished, click the question mark icon again to exit the help mode.
  22.  
  23. To use the demo desk accessory, install the file “Demo ChemIntosh” in
  24. the system file with Font/DA Mover and put a copy of the file
  25. “ChemIntosh” in the system folder.
  26.  
  27. The introductory price for ChemIntosh DA is $149 through
  28. 31 July 1987 ($295 after).  A simpler desk accessory for drawing
  29. chemical structures, ChemPanion DA, is priced at $75 through
  30. 31 July 1987 ($149 after).  For more information, call SoftShell
  31. Company at 716-334-7150 or write to us at PO Box 632,
  32. Henrietta, NY, 14467.
  33.  
  34. The ChemIntosh Window
  35.  
  36. The desk accessory is operated by using palette tools which are
  37. positioned along the left edge in two columns.  A second set of
  38. palette tools appears when the caps-lock key is down.  A panel
  39. appears just below the title bar to create, edit, and display chemical
  40. symbol strings prior to placing them in the work area.
  41.  
  42. The Edit Menu
  43.  
  44. The standard commands in the edit menu — undo, cut, copy, and
  45. paste — can be invoked within ChemIntosh.  Any operation that
  46. changes, deletes, or adds objects can be undone except those for
  47. editing text.
  48.  
  49. Bonds
  50.  
  51. The palettes contain several tools for drawing bonds — wedge, bold,
  52. hashed wedge, hash, wavy, dashed, plus single, double, and triple
  53. bonds with the same tool.  New bonds are created by dragging the
  54. mouse.  A line showing the location of the bond to be created follows
  55. the mouse movement.  In normal operation, the length for the bond is
  56. fixed and the angle is forced to a multiple of 15°.  The constraint on
  57. the length of a bond is removed by holding the shift key down.  The
  58. constraint on the angle is removed by holding the option key down.
  59. The type or direction of a bond is changed by a click at the center.
  60.  
  61. To start bonds with an endpoint at an existing atom, the desk
  62. accessory provides a margin for error — a hit box — in accessing the
  63. existing atom’s coordinates.  If you press or release the mouse button
  64. when the atom’s hit box is visible, the coordinates of the atom rather
  65. than the cursor are used.
  66.  
  67. The standard bond length, angle, and hit box size are changed with the
  68. palette tool which customizes ChemIntosh.  In addition, the
  69. characteristics for many other objects can be changed with this tool.
  70.  
  71. Rings
  72.  
  73. The two palettes contain several tools for rings.  New rings are
  74. created by dragging the mouse.  The length and orientation of the
  75. first bond determine the size and orientation of the ring.  As with
  76. bonds, the length is fixed and the angle is forced to a multiple of 15°.
  77. Holding down the shift and option keys removes these constraints.
  78.  
  79. Benzene rings are formed with a tool that automatically places a
  80. circle within the hexagon.  Dragging over a bond in an existing
  81. cyclohexane ring adds a circle to the center.  If any atom in the ring
  82. is deleted or any bond is deleted or changed, the circle is deleted.
  83. Five-membered unsymmetrical rings are formed with two palette
  84. tools.  The desk accessory selects the starting bond for these rings,
  85. either the left or the right, to keep the ring orientation consistent
  86. with the palette symbol.  The chair and boat conformations of
  87. cyclohexane are simple to create with palette tools.
  88.  
  89. Chemical Symbol Strings
  90.  
  91. The standard Macintosh text editing techniques are used to create
  92. chemical symbol strings in the symbol-string panel before the string
  93. is placed in the work area with the palette tool (the icon is an ether
  94. moeity).  Chemical symbol strings are placed in the work area in
  95. several different ways with this tool.  Click any number of atoms to
  96. replace them with a single heteroatom in the panel.  Individual atoms
  97. can also be replaced by symbol strings containing more than one atom.
  98. The string is automatically positioned away from the adjacent atoms.
  99. The automatic placement can be overriden as required.  Symbol strings
  100. can be placed in the work area without replacing an existing atom.
  101. Click twice in the work area to desposit the string at the second click.
  102. Symbol-string substituents can be attached to an existing structure
  103. with a single bond in one step by accessing an atom and then dragging
  104. the mouse.  The font, size, or style is set for chemical symbol strings
  105. with a palette tool.
  106.  
  107. Straight Arrows
  108.  
  109. The palettes contain several tools for drawing straight arrows.
  110. Straight arrows are created and modified by using operations identical
  111. to those for bonds.  
  112.  
  113. Circles, Ovals, Arcs, and Arcs with Arrows at the Endpoints
  114.  
  115. A tool in the main palette, represented by a curved arrow and circle,
  116. is used to draw circles, ovals, arcs, and arcs with arrows at the ends.
  117. A complementary tool is used to create dashed versions of the same
  118. objects.  Drag the mouse in the work area to draw a circle.  Dragging
  119. in the horizontal direction changes the size.  The constraint forcing
  120. the object to be a circle rather than an oval is released by holding the
  121. shift key down.  When the mouse button is released, handles are drawn
  122. at the corners.  These handles indicate that the object can be deleted,
  123. repositioned, resized, or changed to a different object.  An active
  124. object can be deleted with the backspace key.  An object is
  125. repositioned by dragging it.  An object is resized by dragging a corner.
  126. An arc is an extension of a circle or an oval.  An active circle or oval is
  127. changed to an arc by dragging the mouse in the work area.  Arrows are
  128. added or removed at the endpoints of an arc with just a click at an
  129. endpoint.  The tool also has a feature for creating arrows which move
  130. electrons between bonds of the same atom.
  131.  
  132. Other Objects
  133.  
  134. Large brackets for enclosing repeating groups are created with a tool
  135. by dragging the mouse.  A dot for representing stereochemistry is
  136. placed on atoms with a click by using a tool.  Dots are removed with
  137. a second click.  The text palette tool represented by a “T” is used to
  138. create and edit blocks of text.  The tool uses conventional Macintosh
  139. text editing features.  ChemIntosh DA accepts “pictures” created with
  140. MacDraw, MacDraft, SuperPaint, and other applications by using the
  141. paste command in the edit menu.
  142.  
  143. The Selection Tool
  144.  
  145. The selection tool, represented by an arrow icon, functions in a manner
  146. similar to the selection tool in MacDraw.  Objects are selected with a
  147. click.  The selection is extended with a shift-click.  Several nearby
  148. objects can be selected at once with the selection rectangle.
  149.  
  150. One or more selected objects can be repositioned by pressing the
  151. mouse within the rectangle framed by the handles for an object and
  152. dragging the framed outline of the objects.  The selected objects are
  153. duplicated and repositioned by holding the option key down when the
  154. mouse button is released at the end of the drag.
  155.  
  156. One or more selected objects can be resized by pressing the mouse
  157. within a handle for an object and dragging the framed outline of the
  158. objects to resize them.  The selected objects are duplicated and
  159. resized by holding the option key down when the mouse button is
  160. released.
  161.  
  162. The selection tool has a few other uses.  The font characteristics for
  163. a selected text block are changed by selecting a new font, style, or
  164. size with the font tool, representing by an “F”.  Selected objects can
  165. be copied to the clipboard with the cut or copy commands in the edit
  166. menu.
  167.  
  168. Deleting Objects
  169.  
  170. The backspace key and the clear command in the edit menu delete
  171. selected objects.  Objects can also be deleted with a single click by
  172. using the eraser tool.  Atoms are deleted by clicking within the hit
  173. box.  The adjacent bonds are deleted in the same step.  Bonds are
  174. deleted by clicking within their hit box too.
  175.  
  176. Page Layout
  177.  
  178. Three tools are helpful for page layout.  Clicking the alignment tool
  179. displays a dialog box to choose how to align previously selected
  180. objects.  If the option key is down when the icon is clicked, the
  181. previously selected alignment option is used to align the objects.
  182. To determine your position within the document, click the ruler icon in
  183. the caps-lock-down palette.  Click the highlighted icon to remove the
  184. rulers.  The show-full-page palette item is useful for positioning
  185. objects within the document too.  When the icon is clicked, the work
  186. area is moved to the right and a view of the entire document is
  187. depicted on the left.  Click the highlighted icon to remove the full-page
  188. view.
  189.  
  190. Printing
  191.  
  192. Documents can be printed on either ImageWriter or LaserWriter
  193. printers.
  194.  
  195. Saving and Opening Documents
  196.  
  197. A document is saved by clicking the save icon, represented by an
  198. arrow pointing into the disk.  The document is saved under a new name
  199. by clicking the icon with the option key down.  A document is opened
  200. by clicking the open icon, represented by an arrow pointing out of
  201. the disk.
  202.  
  203. ©1987 SoftShell Company.  All rights reserved.  ChemIntosh and
  204. ChemPanion are trademarks of SoftShell Company.  Macintosh is a
  205. trademark of McIntosh Laboratory, Inc., licensed to Apple Computer,
  206. Inc., and is used with express permission of its owner.  MacDraw,
  207. ImageWriter, and LaserWriter are registered  trademarks of Apple
  208. Computer, Inc.
  209.